免疫耐受主要存在于“大三阳”的慢性乙肝病毒携带期，免疫耐受性越强，病毒复制水平越高，即使血清病毒水平很高，免疫耐受性强也不会发病。然后随着年岁增长，免疫耐受性会逐渐衰落，免疫清除力会逐渐增强，使血清病毒水平逐渐降低。长期“大三阳”后会转变“小三阳”，“小三阳”的携带者已经没有免疫耐受性，血清中也检不出乙肝病毒了。 　　大约有25%“大三阳”慢性乙肝病毒携带者会发生慢性乙型肝炎，慢性肝炎发病了就说明免疫耐受性相对变弱了，但耐受性的强弱仍有很大差异：刚发病的“大三阳”慢性肝炎仍有相当的免疫耐受性，病毒水平较高而干扰素治疗效果较差，病毒水平越高病变越轻；随着时间推移，耐受性逐渐削弱，病毒水平逐渐降低而病变却逐渐加重；到“小三阳”慢性肝炎几乎已经没有耐受性了，病毒水平很低，但病毒水平与病变程度一致。